Aziende che rilasciano prodotti su piattaforma Lamp difficilmente usano CMS già fatti per svariati motivi e primo fra tutti è il pessimo controllo sul codice, a meno che non lo si conosca a menadito. Quello che si fa, di solito, è costruirsi un proprio framework, magari partendo da uno già fatto che permetta una semplice integrazione. Essendo presenti dei framework  sottostanti a joomla e/o wordpress, essi cercano di coprire una vasta gamma di esigenze che possono non essere utili in tutte le occasioni, questo è anche  un altro motivo per scegliere di crearsi dei propri framework. Quindi capisco il tuo disappunto, ma se il tuo cliente vuole una cosa discretamente fatta, in poco tempo e ad un prezzo basso studiarsi un cms opensource può salvarti la vita da ore di lavoro spese ad implementare quelle funzionalità che saltano fuori dell'ultimo incontro con il cliente. 

Con un CMS come joomla è senz'altro vero che la manutenzione è di grand lunga più rapida e facile e meno costosa e a volte non serve neanche un tecnico per farla. Conosco una azienda che ha sviluppato un intero framework personalizzato all'interno di Joomla. Quindi è possibile comunque sia scremare il CMS e renderlo customizzable, proponendo soluzioni sia competitive dal punto di vista commerciale , che di alto grado tecnologico.  E' ovvio che, nostro malgrado, il cliente deve essere in qualche modo soddisfatto e ,nonostante gli sforzi per fargli capire che la nostra soluzione è migliore da alcuni punti di vista, vuole rimanere svincolato da una soluzione personalizzata e legata ad un singolo fornitore. Secondo me è anche un problema "settoriale" e , senza offesa, per aziende che offrono soluzioni con LAMP. In j2ee l'uso di portal container, belli massicci, come liferay sono una garanzia assoluta! In php, mancano gli standard o delle linee guida di progettazione che dovrebbero accomunare le tipologie di applicativi web. Prendendo come base joomla, si potrebbero definire delle specifiche per i cms in php.
My 2 Cents.